NETWORK ANALYSIS TERINTEGRASI MOLECULAR DOCKING DAN DYNAMICS DALAM MENGEKSPLORASI MEKANISME TERAPEUTIK DAUN CIPLUKAN (Physalis angulata Linn) TERHADAP DIABETES TIPE 2

Zaki, Nesfitra Dzakwan (2022) NETWORK ANALYSIS TERINTEGRASI MOLECULAR DOCKING DAN DYNAMICS DALAM MENGEKSPLORASI MEKANISME TERAPEUTIK DAUN CIPLUKAN (Physalis angulata Linn) TERHADAP DIABETES TIPE 2. SKRIPSI. ISSN 1-66

	Text cover.pdf Download (101kB)
	Text SKRIPSI FULL_NESFITRA DZAKWAN ZAKI_F1C121025.pdf Restricted to Repository staff only Download (5MB)
	Text abstrak.pdf Download (102kB)
	Text bab 1.pdf Download (104kB)
	Text Daftar Pustaka.pdf Download (174kB)
	Text BAB 5.pdf Download (98kB)
	Text Daftar Pustaka.pdf Download (174kB)

Abstract

Diabetes melitus tipe 2 adalah penyakit metabolik kronis dengan resistensi insulin dan gangguan regulasi glukosa. Pengobatan konvensional sering memiliki efek samping, sehingga terapi berbasis bahan alami menjadi alternatif. Ciplukan (Physalis angulata Linn) mengandung senyawa bioaktif berpotensi sebagai antidiabetes. Penelitian ini mengidentifikasi mekanisme terapeutiknya menggunakan network analysis, molecular docking, dan molecular dynamics. Metode penelitian mencakup: Network analysis menggunakan datamining 46 senyawa bioaktif dari KNApSAcK dan PubChem, analisis struktur 2D dan 3D dengan ChemDraw dan Chem3D, Prediksi ADMET dengan pKCSM dan Protox II, STRING, OMIM, dan MalaCard untuk mengidentifikasi interaksi senyawa; molecular docking dengan PyRx, PyMOL, dan Discovery Studio untuk memprediksi interaksi antara ligan-protein; simulasi molecular dynamics dengan YASARA untuk mensimulasikan pegerakan molekul dan atom dalam sistem biologis. Hasil penelitian menunjukkan quercetin 7-O-glucoside berinteraksi dengan HIF1 α dan NF-κB1, berperan dalam inflamasi dan metabolisme glukosa. Prediksi ADMET menunjukkan bioavailabilitas tinggi, absorpsi usus baik (HIA > 79%), serta tidak mutagenik. Molecular docking mengungkap quercetin 7-O-glucoside memiliki energi pengikatan terbaik (ΔG = -9,9 kkal/mol) terhadap HIF1-α dengan RMSD 1,451 Å, membentuk ikatan hidrogen dengan His 323 dan Glu 295. Simulasi molecular dynamics menunjukkan kompleks HIF1-α dengan senyawa bioaktif memiliki nilai RMSD rendah (<2Å) dan nilai RMSF yang rendah, menunjukkan stabilitas struktural kompleks selama simulasi.

Type:	Article
Subjects:	L Education > L Education (General)
Divisions:	Fakultas Sains dan Teknologi > Kimia
Depositing User:	ZAKI
Date Deposited:	15 Apr 2025 08:33
Last Modified:	15 Apr 2025 08:33
URI:	https://repository.unja.ac.id/id/eprint/77301

Actions (login required)

View Item